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2018年3月，中共中央办公厅印发了《关于人大预算审查监督重点向支出预算和政策拓展的指导意见》，再次明确要求“各级审计机关应当加强对专项资金绩效和政策执行的审计监督”。只有加强财政专项资金的绩效审计，才能保证财政专项资金规范、高效使用，保障经济健康持续发展。财政专项资金绩效审计，是审计机关在对财政专项资金收支真实性、合法性进行审计的基础上，对资金使用所达到的经济效益、社会效益和生态效益进行的审计和审计评价。
一、关注预算编制情况，提升财政资金绩效。
审计应重点关注：
一是预算编制的完整性，核实本级财政所有收入及支出是否全部纳入“四本预算”管理；
二是预算收支安排依据是否科学，是否符合年度经济社会发展目标、国家宏观调控等政策要求，是否与上一年度预算绩效评价有效挂钩；
三是预算编制的精细化水平，关注各项支出标准是否合理，有无简单套用以前年度标准，导致当年预算编制过大、实际执行过小等编制不科学的问题，以及由于项目储备不充分，导致代编预算规模过大、预算不细化的问题。
审计应重点关注预算资金分配和预算指标下达的及时性，审查各级政府在收到上级转移支付资金后，特别是省级政府收到中央转移支付后，是否及时、科学分解下达。
另外，审计还应关注各级财政存量资金盘活及使用情况。结合资金分解下达后的使用情况，关注是否存在财政资金该盘活未盘活，盘活后资金二次沉淀，或投向不合规、资金使用效益不高的问题。
审计要重点关注预算调整是否报同级人大常委会审议批准，是否存在以调剂程序代替预算调整程序或走过场调整预算的情况，调整用途后的财政资金是否发挥效益。
审计应从确保库款资金安全、高效使用的角度，重点关注地方财政国库现金在各银行的存放比例及期限是否合规，有无超标准存放影响库款安全的问题；审查库款资金调度，关注“三保”等各类重点支出的时效及资金保障情况，杜绝挤占挪用、资金浪费现象发生。
审计应通过分析政府部门一般性支出及各单位“三公经费”支出的规模和结构，关注压减真实性及合理性；关注“三公经费”各项支出合理性。
此外，加大对政府采购及国有资产管理情况的审计，也是开展财政资金绩效审计，促进财政资金提质增效的重点内容。
审计应重点从如何推动健全政府采购及资产管制制度，规范政府采购预算，全面提升资产管理职能，加大资产特别是长期低效运转、闲置资产的统筹使用，提升存量资产效益等方面展开。
