我司是一家检测辅导机构，经常需要去企业视查和采样之类。公司制度有规定，在公司无车可派的情况下，员工可以开自已的车去办公司的业务，可以报销发生的过路费和按1公里1.5元报销油费。现在ETC可以开具过路费发票，发票名称开的是公司名称和税号，但是发票上规格有车的牌号，目前我司税审的时候，就这个发票被剔除，说是非本单位费用不得税前扣除。说这个过路费要拿跟员工签的租车协议去税务局代开才可以？请问真的是这样吗？
根据《中华人民共和国企业所得税法》（中华人民共和国主席令第63号）第八条规定：“企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。”第十条规定：“在计算应纳税所得额时，下列支出不得扣除：……与取得收入无关的其他支出”。根据实质课税原则，企业租用个人车辆所发生的费用若确实与公司生产经营有关，根据对方提供的发票及相关证明资料可按规定在税前扣除。
根据《国家税务总局关于发布<企业所得税税前扣除凭证管理办法>的公告》（国家税务总局公告2018年第28号）第九条规定，企业在境内发生的支出项目属于增值税应税项目(以下简称“应税项目”)的，对方为已办理税务登记的增值税纳税人，其支出以发票(包括按照规定由税务机关代开的发票)作为税前扣除凭证;对方为依法无需办理税务登记的单位或者从事小额零星经营业务的个人，其支出以税务机关代开的发票或者收款凭证及内部凭证作为税前扣除凭证，收款凭证应载明收款单位名称、个人姓名及身份证号、支出项目、收款金额等相关信息。小额零星经营业务的判断标准是个人从事应税项目经营业务的销售额不超过增值税相关政策规定的起征点。税务总局对应税项目开具发票另有规定的，以规定的发票或者票据作为税前扣除凭证。因此，单位租用个人车辆，如果对方为从事小额零星经营业务的个人，其支出可以收款凭证及内部凭证作为税前扣除凭证；如果对方为非从事小额零星业务的个人，应当根据《中华人民共和国发票管理办法》有关规定取得发票（包括按规定由税务机关代开的发票），并以发票作为税前扣除凭证。
根据国家税务总局关于发布《企业所得税税前扣除凭证管理办法》的公告（国家税务总局公告2018年第28号）第九条第二款规定：“小额零星经营业务的判断标准是个人从事应税项目经营业务的销售额不超过增值税相关政策规定的起征点。” 根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及实施细则、《财政部 税务总局关于实施小微企业普惠性税收减免政策的通知》（财税〔2019〕13号）规定，小额零星经营业务可按以下标准判断：按月纳税的，月销售额不超过10万元；按次纳税的，每次（日）销售额不超过300-500元，厦门地区实行500（含本数）以下免征增值税。
综上，企业租用个人车辆所发生的租赁费用，对方为从事小额零星经营业务的个人，其支出可以收款凭证及内部凭证作为税前扣除凭证；如果对方为非从事小额零星业务的个人，应当根据《中华人民共和国发票管理办法》有关规定取得发票（包括按规定由税务机关代开的发票），并以发票作为税前扣除凭证。同时，在租赁期间实际发生的与生产经营有关的费用（过路费、汽油费、停车费等），凭合法有效凭据准予税前扣除。